La Procura di Livorno ha attualmente in organico 8 magistrati di professione (7 sostituti procuratori e il Procuratore della Repubblica), 13 viceprocuratori onorari e di 40 unità di personale amministrativo.
Con riguardo all'attività di indagine, la Procura è organizzata in gruppi di lavoro perché, per le materie che richiedono particolari approfondimenti, lo scambio di valutazioni e di esperienze che sono proprie del lavoro di gruppo permette un'azione più efficace. I gruppi di lavoro, coordinati dal Procuratore della Repubblica, sono 7 e riguardano:
Reati contro la P.A. e reati di falso commessi da P.U.
Reati contro economia e di frode ai danni di enti pubblici
Reati edilizi e contro l'ambiente ed a tutela del territorio
Reati sessuali, da violenza di genere e domestica
Reati contro la saute ed a tutela del lavoro
Reati di competenza del Giudice di Pace
Reati di competenza dell'Ufficio di Collaborazione del Procuratore
Alle udienze – che ogni mese variano da 80 a 100 - partecipano sia i magistrati di professione sia quelli onorari, questi ultimi limitatamente alle udienze davanti al Giudice monocratico e al Giudice di pace; con esclusione quindi delle udienze davanti al collegio del Tribunale, davanti al GIP, davanti al Giudice di sorveglianza e davanti al Giudice civile, a cui presenziano solo i sostituti.
Per le attività di indagine i procedimenti vengono assegnati tra i vari sostituti con un criterio automatico e vi è sempre un magistrato che tratta gli atti urgenti.